单位主管部门拒绝我因重度抑郁症的辞职申请，

您可以先与公司协商，协商不成再考虑法律途径。单位主管部门若拒绝，可能涉及违法。根据《劳动法》，重度抑郁症患者若无法胜任工作，经培训或调岗后仍不胜任，单位可提前30日通知解除劳动合同，但需支付经济补偿。不及时处理，可能导致法律纠纷及赔偿风险。
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如下：1.协商：首先尝试与单位主管部门沟通，表达辞职意愿并了解拒绝原因。2.法律咨询：若协商无果，咨询专业律师，了解自身权益和可能的法律途径。3.劳动仲裁诉讼：准备充分证据，考虑向劳动仲裁委员会申请仲裁，或直接提起诉讼，维护自身权益。
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常见的处理方式是先与单位沟通协商，寻求理解；若协商无果，可咨询律师并准备相应证据，考虑劳动仲裁或诉讼。选择处理方式时，需根据具体情况和证据充分性决定，确保合法权益得到保护。